16S/18S/ITS 擴增子測序

擴增子測序即通過提取環(huán)境樣品的DNA，選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS 的某一或某幾個區(qū)域，使用高通量測序及生物信息分析方法檢測目的區(qū)域的序列變異和豐度，進而對樣本中物種分類及豐度、種群結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進化及群落比較等方面信息進行分析的研究方法。根據(jù)不同的研究目的和需求，主要分為三類：對 16SrDNA 某個高變區(qū)進行測序，用于研究環(huán)境微生物中細菌或古菌的群落結(jié)構(gòu)多樣性；對18SrDNA 某個高變區(qū)進行測序，用于研究環(huán)境樣本中真核微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性；對ITS1 或ITS2 進行測序，用于研究環(huán)境微生物中真菌群落結(jié)構(gòu)多樣性。